VR:s tågsäkerhet är bland EU-länderna på toppnivå. Utgångspunkten är att genom att värna om säkerheten förhindrar man att skador uppstår i miljön, för resenärerna, för personalen och i godset som ska transporteras. Samtidigt säkrar man att verksamheten förlöper utan avbrott och störningar.
Grunden för trafiksäkerheten utgörs av den säkerhetspolitik som VR-Groups styrelse fastställt. Enligt den sköts säkerheten genom en systematisk uppföljning av verksamheten och genom att identifiera de risker som hotar säkerheten. VR definierar hur riskerna ska hanteras och utför korrigeringsåtgärderna. Detta arbete är kontinuerligt och i det beaktas ändringarna i koncernens verksamhet och i verksamhetsmiljön.
År 2008 fastställdes ett nytt säkerhetsprogram för koncernen. Det gäller fram till år 2010.